4000年前，出逃王宫的商朝王孙有莘不破救下太一宗弟子江离，两人结伴游荡荒原，入商队、遭异兽、遇天劫，属于少年的冒险正在展开。在他们的身后，王朝交替、山雨欲来，夏商之间爆发了一场有史以来最伟大的战争。命运的齿轮开始转动，那些天赋异禀的少年，早已身在局中。
全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石头世界里，千空集结新伙伴的力量一起建立“科学王国”，最终目标是用科学的力量复原整个世界。但是，由灵长类最强的高中生狮子王司领导的“武装帝国”却步步为营。旨在净化人类的司试图通过使用强大的力量来阻止科学的发展。 科学 vs 武力的战斗经过激战，千空等人的科学王国占优势，之后两国终于和解。 由于同伴的谋反而处于冷休眠状态的司为了复活全人类，科学王国以石化光线的发生源、地球的背面·新世界作为目标！ 冲出世界解开石化之谜！石头世界大航海时代终于开幕——‼
从古至今，人们惧怕黑暗。因为在人们心中，潜藏著名为“阴我”的负面意念，导致魔兽“骇魔”（Horror）得以利用入侵附身。而人类当中有一群人，手持钢铁利剑，一子单传，秘密守护人类不受“骇魔”侵略，他们被称之为“魔戒骑士”，生于黑暗，也隐于黑暗，世代与“骇魔”进行无止境的战争… 立志成为画家的御月薰，即将举行她首次的个展。但她却也梦见了童年时父亲所画的“黄金骑士”绘本，让她非常在意。虽然与心理咨询师龙崎驱音谈过之后，薰总算能安心迎接个展，但画廊老板却突然化为了异形怪物向她袭击。这时，在薰眼前出现了一名身穿白色大衣的神秘青年，并变身打倒了怪物。而他变身后的模样，正巧与绘本中所画的“黄金骑士”如出一辙……
