故事紧接着上一季“死亡天使”之后的情节，Tony 仍以 Anthony DiNardo 的身份进行卧底，并遇到了 Jeanne 的父亲 La Grenouille，Grenouille 知道 Tony 华盛顿的一家酒店发生了爆炸，海军部长Clayton Jarvis当场身亡，国土安全部副主任Tom Morrow也身受重伤。在酒店外目睹了这一切的Parsons，似乎从中领悟到了什么。\n\nGibbs 《海军罪案调查处》第六季的首播集里，NCIS 团队调查了一名海军士官的谋杀案。伴随着喷溅的鲜血，一个被开膛破肚的海军上尉临死前用自己的血液写下了一个数字。在调查案件的同时，Gibbs 还要努力应对 V 在第四季的开始，Gibbs从NCIS退休去了墨西哥，团队现在由Tony负责。Ziva因为在偶然间目睹了一场政治暗杀的全过程，而被联邦调查局怀疑是双重间谍认定她就是凶手，Ziva被迫成为罪犯开始逃亡。\ 现在，老朋友Fornell非常需要大家的帮助，因为他的女儿Emily逃离了戒毒所。Gibbs借口“鲟鱼季节”到了，离开NCIS总部，并让McGee全权负责案件调查。Fornell秘密监视着一名毒贩，在 随着《海军罪案调查处》第十九季的到来，从谋杀、间谍活动到恐怖主义，这些特工们又继续开始了他们的工作。由于Bishop的离开和Gibbs的失踪，McGee和Torres试图说服Vance让探员Jessi Ziva 为了找寻心中的答案，参加了摩萨德对索马里 Saleem Ulman 的围剿。然而，她所搭乘的“达摩克里斯”在航行中遇到了船难，Ziva 在海上失踪了。Tony 拒绝相信她已经死亡，在找到证据 NCIS 的卧底特工 Nick Torres 在阿根廷执行任务时失联，他的姐姐 Lucia Campbell 少校前往阿根廷寻找他的下落。在回家途中，Lucia 乘坐的车辆被人安置了定时炸弹，她和女儿 新任海军部长Clayton Jarvis交给了Tony一个关于微型芯片的秘密任务，并下令让他对NCIS探员Cade进行调查。Tony利用EJ找到了失踪的Cade，但神秘杀手Casey Stratton NCIS系统管理员Kevin Hussein前往莫斯科，将因癌症而死亡的叔叔的遗体托运回国内，突然他发现自己正被人监视跟踪，于是便向美国大使馆请求帮助。\n\nGibbs和McGee在搭乘军用直升机护 
