所谓宝可梦，是指生活在这个星球上。许许多多的非常不可思议的生物。它们的身影在天空、大海、森林、街道中随处可见。拥有不可思议吊坠的来自帕底亚的少女，莉可。拥有迷之精灵球的来自关都的少年，罗伊。莉可和罗伊在广阔的宝可梦世界中开始了全新冒险！等待着他们的命运，究竟会如何呢——？！这是一个通过冒险来“发现”重要事物的故事。初到石英学院的少女莉可，在这里得到了她的第一只宝可梦新叶喵。在她与新叶喵逐渐熟悉的过程中，一个神秘的组织——探索者队，为了得到莉可的神秘吊坠前来追捕她。还好莉可并不是独自一人，弗雷德、船长皮卡丘以及其他上升伏特攻击队的成员们，在他们的英勇浅葱号上向莉可提供了庇护。而梦想成为宝可梦训练家的少年罗伊，携带着隐藏着秘密的精灵球。当莉可、罗伊以及上升伏特攻击队向着新的地平线启航，等待他们的将会是什么？